«Разящий меч нового Синсэнгуми»

Семнадцатилетний Шиничи Кудо обладает развитыми аналитическими способностями, за что получил прозвище "современный Шерлок Холмс". Во время возвращения домой с подругой детства Ран Мори он становится свидетелем деятельности преступной группировки. Члены организации замечают юношу, задерживают его и принудительно дают ему принять экспериментальное лекарство.

После потери сознания Шиничи приходит в себя и обнаруживает, что его тело уменьшилось до размеров семилетнего ребенка. Чтобы скрыться от преследующих его преступников, он принимает решение обратиться к Ран. Под видом родственника он поселяется в доме Мори, где знакомится с отцом девушки - владельцем детективного агентства.

Сохранив интеллектуальные способности и профессиональные навыки, Шиничи начинает участвовать в расследовании уголовных дел. Под именем Конан Эдогавы он помогает в работе детективного агентства, параллельно пытаясь найти способ восстановить свой первоначальный облик и раскрыть деятельность преступной организации.